Kasus COVID-19 mencapai tingkat tinggi, dan varian virus, seperti delta, bahkan lebih menular daripada jenis aslinya. Jadi bagaimana tepatnya kita melacak ini?
Swab PCR yang nyaman
Selama bertahun-tahun, negara bagian Washington telah menggunakan teknologi yang disebut pengurutan genom. Sekuensing genom pada dasarnya adalah cara memetakan sidik jari (atau cetak biru) suatu organisme, atau sel. Dokter dan ilmuwan menggunakan informasi ini untuk melacak berbagai penyakit dan virus. Ini penting untuk membuat prediksi (atau model) untuk membantu menjaga orang tetap aman.
Kami berbicara dengan Ahli Epidemiologi Negara untuk Penyakit Menular, Dr. Scott Lindquist, untuk mempelajari bagaimana pengurutan genom digunakan untuk membantu kami mengungkap informasi penting tentang virus, seperti COVID-19.
Sebelum kita masuk, penting untuk memahami apa itu virus. Menurut Genome.gov, virus adalah kumpulan kecil kode genetik, baik DNA atau RNA, yang dikelilingi oleh lapisan protein. Virus tidak dapat mereplikasi, atau membuat salinan dari dirinya sendiri, sendirian. Mereka harus menginfeksi “sel inang” dan menggunakan bagian dari sel itu untuk bereplikasi. Seringkali, sel inang dihancurkan dalam prosesnya, yang mengakibatkan kerusakan pada organisme inang. Sekarang ke wawancara kami:
Terima kasih telah duduk bersama kami Dr. Lindquist! Apa itu sekuensing genom?
Ini adalah metode laboratorium yang digunakan untuk menentukan seluruh susunan genetik organisme tertentu. Untuk penyakit menular, digunakan pada virus, bakteri, dan bahkan parasit.
Untuk apa sekuensing genom dapat digunakan?
Pengurutan genom dapat membantu mengidentifikasi wabah virus atau bakteri serta mengidentifikasi varian virus. Sebagai contoh, mari kita lihat wabah E.coli (bakteri). Katakanlah ada 700 kasus E.coli yang dilaporkan dalam waktu singkat. Sampel-sampel tersebut diurutkan dan ditemukan tiga sampel yang persis sama. Kemudian, Anda dapat kembali ke tiga orang yang menguji strain yang cocok dan mencari tahu kesamaan mereka, seperti di mana atau apa yang mereka makan sebelum mereka sakit, sehingga menentukan asal mula wabah.
Di masa lalu, kami menggunakan pengurutan genom untuk mendeteksi wabah tuberkulosis; untuk mengklasifikasikan wabah hepatitis dan melacaknya kembali ke kasus pertama; dan untuk memahami kelompok atau wabah virus.
Bagaimana sekuensing genom digunakan selama pandemi COVID-19?
Pengurutan genom sangat penting untuk mempelajari lebih lanjut tentang COVID-19. Virus COVID-19 (SARS-CoV-2) memiliki kode RNA yang dapat dibaca oleh sekuensing genom. Pengurutan genom mengisolasi virus, membongkar RNA, dan memetakannya — ia berjalan sepotong demi sepotong dan merekonstruksi urutan RNA.
Setelah urutan ditentukan, para ilmuwan dapat mulai mengenali pola dan membandingkan urutan untuk mendeteksi hal-hal seperti varian virus paling umum pada waktu tertentu.
Mengapa ini penting?
Penting untuk memahami bagaimana varian menyebar. Dengan menggunakan teknologi ini, para ilmuwan Washington menentukan bahwa lebih dari 98 persen virus yang saat ini mereka uji adalah varian Delta. Selama bulan Juli 2021, Washington mengurutkan 20,5 persen dari semua kasus positif yang dikonfirmasi dengan tes molekuler. Proporsi kasus positif yang kami urutkan menempatkan kami di antara yang tertinggi di negara ini, menurut Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC).
Kami menggunakan pengurutan genom untuk melacak semua varian COVID-19 di Washington. Untuk informasi terperinci dan data terkini (diperbarui setiap minggu) tentang varian COVID-19 di negara bagian Washington, lihat Laporan Urutan dan Varian DOH.
Apa penemuan terbesar Washington dengan sekuensing genom sejauh ini?
Jumlah varian COVID-19 telah menjadi salah satu penemuan terbaru terbesar! DOH memberikan laporan mingguan tentang delapan varian COVID-19 [saat ini] yang telah muncul di negara bagian kita.
Seperti apa masa depan sekuensing genom di Washington?
Washington telah menjadi salah satu pemimpin pengurutan genom di AS dan telah banyak berinvestasi dalam pengurutan genom. Setelah pandemi COVID-19 mereda, kami akan menggunakan teknologi untuk mendeteksi, melacak, dan memantau virus lain seperti hepatitis, TBC, dan jenis wabah virus atau bakteri lainnya.
Informasi lebih lanjut
Blog ini akurat pada tanggal posting. Informasi berubah dengan cepat, jadi periksa situs web COVID-19 negara bagian untuk info terbaru di coronavirus.wa.gov. Anda juga dapat mendaftar untuk diberi tahu setiap kali kami memposting artikel baru.
Vaksin COVID-19 sekarang tersedia untuk semua orang berusia 12 tahun ke atas. Untuk informasi lebih lanjut tentang vaksin, kunjungi CovidVaccineWA.org dan gunakan alat pencari vaksin untuk menemukan janji temu. Vaksin COVID-19 diberikan secara gratis kepada Anda.
Swab PCR yang nyaman